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遗传学示例:模型与参考答案差在哪里

首批模型给出了同一个 9 位序列,题库参考答案是 15 位。逐一核对六种读取方式和题目指定的两处变化后,差别已经确定:模型在停止翻译的位置截断,参考答案继续包含停止信号和后面的一段。

按原题一步步计算

原序列为 5′ CTT CCC CGC ACA AGT GGT 3′。六种读取方式中,只有下面这一种含有两种其他读取方式都没有的氨基酸:

TTC CCC GCA CAA GTG → F P A Q V

其中独有的是 F 和 Q。按题目要求,每处只改一个碱基:

原片段改后片段变化
TTCTGCF 改为题目要求的 C
CAATAAQ 改为停止信号

修改后的完整片段因此是:

TGC CCC GCA TAA GTG → C P A 停止 V

两个答案各自覆盖什么

读取范围应与之结合的序列
停止之前实际译成氨基酸的片段:TGC CCC GCA5′ TGC GGG GCA 3′,9 位,与首批模型回答相同
修改后的全部完整三联体,包含停止信号及其后的 GTG5′ CAC TTA TGC GGG GCA 3′,15 位,与题库参考答案相同

原题最后要求“only include sequences that are translated into amino acids”。按遇到停止信号便终止的通常读法,9 位答案有明确依据;15 位参考答案覆盖的范围更大。由此得到的零分,不能直接解释为模型没有解出前面的读取方式和两处变化。

示例怎样展示

当前保存的分数仍按原参考答案计算,页面称为“原参考分”;实际答案和这一分歧一起展示。原答案匹配与否、解题过程是否正确,需要分别阅读。

这道题可以展示整套实验怎样执行,但比较各模型能力时需要先解决题意和参考答案的范围冲突。六种读取方式与逐步计算记录由本地计算得到,没有调用模型,也没有改动实验分数。

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